CLB được thành lập năm 1874 với tên gọi Biggleswade. Đầu tiên CLB chơi ở Fairfield, dùng chung với CLB cricket địa phương, chỉ thi đấu các trận giao hữu và cup cho đến cuối những năm 1890.[1] Năm 1902 họ là thành viên sáng lập của Biggleswade and District League, và là nhà vô địch đầu tiên, cũng như vô địch Bedfordshire Senior Cup trong năm đó. CLB tiếp tục vô địch 2 lần nữa trước khi Thế chiến thứ I xảy ra, và cũng thi đấu ở Bedford & District League từ năm 1909 đến năm 1912.[1]

Năm 1920, CLB gia nhập Northamptonshire League, sau này năm 1934 trở thành United Counties League, và vô địch Bedfordshire Premier Cup ở mùa giải 1922–23 và 1927–28.[2] Sau Thế chiến thứ II CLB mang tên như hiện tại và gia nhập Spartan League năm 1945. Họ trở lại UCL năm 1951, trước khi chuyển sang Eastern Counties League năm 1955. Trong suốt thời gian ở ECL họ đã lập kỉ lục trận thắng đậm nhất trên sân khách với chiến thắng 12–0 trước Newmarket Town. Năm 1963, đội bóng trở lại UCL vì chi phí di chuyển tăng.[1] Mùa giải 1975–76 họ xếp cuối bảng ở Premier Division và bị xuống hạng.

Năm 1980, họ gia nhập Premier Division của South Midlands League.[3] Đội bóng bị xuống hạng Division One năm 1983, nhưng thăng hạng trở lại Premier Division năm 1987. Khi Spartan League và South Midlands League hợp nhất thành Spartan South Midlands League năm 1997 CLB được xếp vào Premier Division North. Mùa giải sau đó họ được xếp vào Senior Division, sau khi xếp thứ 5 chung cuộc thì được thăng hạng Premier Division.

Năm 2006 CLB rời Fairfield Road và sân chung với Bedford United & Valerio, và một sân vận động mới được xây dựng ở Langford Road, có tên là Carlsberg Stadium. Mùa giải 2007–08 họ vô địch Bedfordshire Premier Cup lần thứ 3, đánh bại Luton Town 3–2 trong trận chung kết. Mùa tiếp theo họ giành danh hiệu vô địch, thăng hạng Division One Midlands của Southern League.

Đến mùa giải 2012–13, CLB thành lập một đội dự bị dưới cái tên " AFC Biggleswade & Academy ", bắt đầu thi đấu ở Bedfordshire County Football League Premier Division.[4]

Mùa giải 2012–13 chứng kiến The Waders kết thúc ở vị trí thứ 4 và giành một suất đá play-off, đánh bại Rugby Town 3-1 để thăng hạng lên Evo-Stik Southern League Premier.[5]